Hola Rubén. Es un gusto de aceptar como amigos a quienes gustan y utilizan el software libre. Con mi familia venimos utilizando distintas distribuciones Linux desde el año 2006. Aun tengo guardados discos de Ubuntu 7.04. Kubuntu 7.04 y Edubuntu 32 y 64 bits, originales. Horas de instalaciones, pruebas y sistemas rotos... Pero es así como se aprende.
Bien, en cuanto a volver para atrás a Nautilus, no me fue demasiado simple, ya que el que trae Tuquito 5 Pampa es Nautilus Elementary, que son un conjunto de mejoras visuales y otras funciones interesantes.
Para ello desde el Gestor de Paquetes Synaptic fui a la pestaña "Configuración" y desde allí a "Repositorios"; desde "Orígenes del Software" fui a "Otro Software" y busque la linea de "http://ppa.launchpad.net/am-monkeyd/nautilus-elementary-ppa/ubuntu natty main" y la desmarqué. Al cerrar tuve que recargar todos los paquetes.
Terminado esto siempre desde el Synaptic fui a querer reinstalar el Nautilus, pero no lo permitía, sólo desinstalar y desinstalar completamente.  Accedí a esta última, pero aquí surgió el inconveniente, se llevaba la sesión de Gnome con él... Y le di que si... Hasta ahí todo bien. Tuquito siguió sin problemas y el Natilus no tenía los cambios. Así que reinicié y ahí la sorpresa... o no tanto... no tenía más sesión Gnome... Y no inició!!! Pero ahí estaban para elegir XFCE y KDE esperando, que ya hace un tiempo había instalado. Inicié en XFCE, abrí Synaptic y marqué "Nautilus" y "Gnome-sesion". Ya con todo cargado reinicié y allí estaba nuevamente Gnome y ya con Nautilus a la "vieja usanza".
Hoy por la tarde hice el paso inverso, está Nautilus-Elementary nuevamente, con la sorpresa que no está igual que antes. En el panel lateral solo aparecen "Carpeta Personal" y abajo "Sistema de Archivos". Pero lo bueno es que se pueden abrir en forma de "Árbol"...
Conclusión: Creo que  con seguir todos estos pasos y con los eventuales inconvenientes que se puedan presentar, me animo a sugerir que sigas con Nautilus "como viene de fábrica" y si quieres tener una vista de "Árbol" al menos, instales Thunar.
Es rápido y funciona muy bien. Yo lo estoy haciendo y estoy conforme. También desde Gnome y por tener instalado KDE, puedo abrir archivos con Dolphin.
Un abrazo rompe-costillas y que tengas el mejor resultado para el "Navegador de Archivos".
De Hugo, para los amigos...